As variações são diferenciações que um produto com variantes pode ter ao ser cadastrado, como, por exemplo, ter a variação "Cor" com variantes de "Azul" e "Amarelo".
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Para cadastrar uma Variação é só seguir o menu "Produtos" e a opção "Variações", após isso, clicar no botão "+ Nova variação".

Após clicar neste botão, irá para o formulário de variações, onde lá, conseguirá cadastrar tudo o que precisa.

"Nome da variação" - É o nome do qual deseja atribuir a variação, por exemplo: "Tamanho".
​ "Opções" - São as opções de variantes dessa variação, por exemplo para a variação "Tamanho", podemos ter Opções de "P", "M", "G" e "GG".

Esse cadastro pode ser feito também no próprio cadastro de produto com variantes, na aba de variações. Mais explicações sobre essa parte, você encontra em outro de nossos artigos, onde explica de forma mais eficaz o cadastro de produto com variantes: Como cadastrar um produto com opções (variantes)?